江西农学院的前身是国立中正大学农学院。国立中正大学于1940年10月31日创建于江西省泰和县的杏岭。
1934年夏，蒋介石与当时江西省政府主席熊式辉同游庐山秀峰，蒋有在此处办大学之念头。熊式辉秉承蒋介石的旨意，以满足桑梓父老兴办大学的夙愿为缘由，正式提出在江西创设中正大学的建议。1936年，蒋拨款100万元，作为创办基金。“七七”事变后，这个计划一度被搁置。1939年5月，熊式辉在重庆邀请在川的专家学者，“详慎研讨”在江西创办大学的计划。8月底，熊又邀请邱椿、许德珩、罗德基、王造时、雷洁琼、程时火奎等数十人在江西遂川讨论研究，并组织筹备委员会。筹委会下设校舍设备、图书仪器、教育计划等3个专门委员会，分别由程时火奎、邱椿、马博庵等人负责。校名拟定江西省立中正大学。会议之后，各专门委员会开展了筹备工作，确定的校址为泰和县杏岭。因为1939年前后日本侵略军发动大规模进攻攻，致使武汉、南昌、福州、广州等城市相继陷落。中国共产党领导的各抗日根据地军民奋勇抗敌，有力地消灭和牵制日本侵略军。抗战进入相持阶段，赣西、赣南基本上无战事。江西省政府迁往赣西南的泰和县，使这个偏僻的县城成了东南数省的重镇之一。当时附近几个省有抱负的青年学生大批涌入赣西南，生源充足，客观上造成了一个办学的条件和环境。
1940年初，筹委会委派马博庵等3位委员到重庆，向蒋介石、陈立夫（当时任教育部长）汇报了筹备情况。4月，国民党行政院通过决议，定校名为“国立中正大学”，直属教育部领导。6月，中正大学筹委会在泰和县城郊的杏岭正式办公。由教育部聘请熊式辉、程时火奎、邱椿、肖纯锦、罗延光、马博庵、蔡方荫、朱有骞为筹委会正式委员，熊式辉为主任委员。
1940年10月初，由国民中央政府任命的国立中正大学首任校长、著名生物学家胡先驌教授到职（江西新建人）。10月4日，招收的第一届新生到校，31日正式开学。校长胡先驌早年留学美国，获加州大学学士、硕士学位、后又获哈佛大学博士学位。他在就职典礼上说，“本人治校，‘教’与‘育’并重，希望造就多数专家”；在教学方法上，“不竞务新奇，亦不拘守陈说”.在他任校长的4年里，学校在教学、学术研究、师资构建、实验室设置以及物质建设各方面都取得较快的发展，成绩斐然。
国立中正大学分设三处三院一部，即教务处、训导处、总务处；文法学院、工学院、农学院和研究部。学校设校务委员会，是学校最高决策机构。校务委员会设常务会议。学校还设有招生、出版、图书、校舍设计、基金、卫生等专门委员会。
学校在1940年、1941年两年间获拨款30万元，购置图书、仪器设备等，三院一部均有较大发展。农学院下设农艺系、畜牧兽医系、森林系，1941年又增设生物系。农学院创建了农场、牧场、林场、动植物培育园，陆续建立了昆虫、植物病理、果树作物、农作物、造林、森林利用、寄生虫等研究室和实验室，拥有高倍显微镜20多架，搜集了珍贵标本与切片数千种，广西植物腊叶标本万余种。
农学院院长周拾禄是国内很有影响的农学家，知人善任。在这个学院任教的颇有影响的教师有张明善、杨惟义、任明道、鲁昭祷、张昭骞、严楚江、冯言安、马大浦、卢润孚、戴立生、何琦、李静涵、盛彤生、王宗祐、黄野萝、周宗璜、陈封怀等人。1948年后，又有郑体华、彭文和、林启鹏等。
国立中正大学创立初期仅有教授、副教授40人。经过几年的发展，师生数逐年增加，并在赣县的龙岭设立了分校。至1944年4月胡先驌校长离任时，校本部已有专任教师203人，其中教授71人，副教授39人。系科由原来的9个增加至14个，学生人数达1386年。1946年，在校学生增至1414人（其中女生110人），是学生最多的一年。国立中正大学毕业生前后共6届。解放前有5届，共1622人。毕业本科生1310人（其中农学院毕业生192人）。毕业的专科生共312人。第6届于解放后（1949年6月）毕业，本科毕业生260人。
学校除出版多种学术著作和译作外，还出版发行了多种刊物，在全国颇有影响。有《国立中正大学校刊》、《文史季刊》、《地方建设》、《正大土木》、《正大农学季刊》、《正大青年》、《国立中正大学学生》等14种。《正大农学季刊》由农学院编辑，主编周拾禄。1942年3月1日创刊，1943年6月1日后停刊，刊载农学研究论文。停刊主要原因是经费匮乏。
受战乱影响，1945年迁校至宁都长胜。龙岭分校亦随之搬迁并入校本部。8月抗日战争胜利，学校拟选定正式校址，经过一番议论，决定利用南昌望城岗国民党军营为临时校址，1946年1月7日学校复课。但迁校到望城岗仅是权宜之计，学校永久校址尚未确定。7月中旬，学校研究拟迁往庐山，并派人员前往庐山勘察永久校址（建校时就有此想法）。但由于交通不便，加上建校舍困难，终使迁校庐山的庞大规划告吹。望城岗校址直至解放。
继胡先嘯校长之后（1944年4月后）教育部任命肖渠教授为校长。肖渠，江西泰和人，经济学家。早年留学美国，获密苏里大学学士学位，康乃尔大学硕士学位，后入哈佛大学经济研究所从事研究工作。1947年6月，肖渠校长在学潮中辞职。在他任校长期间，学校虽处于困难时期，但各方面的工作有所推进，尤其是校务工作。1947年8月，国民党当局派林一民为校长。林一民系江西上饶人，早年留学美国。1949年国民党反动派在大陆的崩溃已成定局。林一民等人于4月23日仓忙离校去台湾。
1949年5月22日南昌解放，8月更名为国立南昌大学。
(执笔：柳志慎、廖 明)
